1风管方位布置和其他管线方位抵触，甚至送回风管彼此抵触。

2工艺设备与进回风口方位矛盾，设备阻挡进回风口，影响风流，从而影响微生物和微粒控制及出现温度变化梯度。

3工艺设备本体散热、废油气排放，此项与设备选型订货有关、若考虑不周，后续改造较困难。

4空调水系统过滤方位，主机供货商一般要求进出水口另设过滤保护主机。

5恒温、恒湿间风流设计，不宜采取风口送回风，会有温湿度不均匀现象。

6净化级别不同区域人流、物流安排不畅，甚至交叉;活菌区和无菌区人流、物流安排不畅，甚至交叉;物料、半制品、制品及其不合格品的堆积不合理，甚至没有堆积场所。

7工艺设备自身排风，会造成部分风量不平衡，改变气流，特别注意有轴流风机部位，轴流风机噪音消除也应注重。

8工艺设备数量不确定的空调系统宜预留足够余量。应考虑添加的工艺设备自身散热。

9各种水电预留管线方位、容量与工艺设备的配套状况。

10灯具方位和风口方位发生抵触。

11消防排烟管道和送回风管道的连锁，排烟管道将不同洁净区联通，甚至将无菌区和活菌区联通等;

12排风管道直接将净化无尘车间和外界勾结，甚至将有毒有害气体直接排入大气。

13洁净区的排水(地漏及其它工艺排水)往往被设计忽视，这样无意中将洁净间和外界勾结，给净化无尘车间带来危险。净化无尘车间的万级以上区域一般要防止地漏，其它洁净间地漏也要求设空气破除设备，并且平常要求封闭，使用必须有严厉的操作SOP。设备、水池等排水也要求设空气破除设备防止空气、水倒灌给净化无尘车间带来危险。

14净化无尘车间的万级以上区域风管一般需求设置检修清洗口，风管中采用圆形倒角和转弯以防止死角，但在国内设计中一般被忽视。